MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica D174

Total Repeats: 52571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021739	ATT	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021739	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021739	GAT	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662556
4	NC_021739	ATC	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662556
5	NC_021739	GAT	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662556
6	NC_021739	GAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662556
7	NC_021739	TCGG	2	8	500	507	0 %	25 %	50 %	25 %	525662556
8	NC_021739	ATT	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662556
9	NC_021739	TAG	2	6	576	581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662556
10	NC_021739	TTG	2	6	618	623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662556
11	NC_021739	TG	3	6	642	647	0 %	50 %	50 %	0 %	525662556
12	NC_021739	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662556
13	NC_021739	CGTT	2	8	785	792	0 %	50 %	25 %	25 %	525662556
14	NC_021739	GCA	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662556
15	NC_021739	AT	3	6	1024	1029	50 %	50 %	0 %	0 %	525662557
16	NC_021739	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	525662557
17	NC_021739	CCAA	2	8	1244	1251	50 %	0 %	0 %	50 %	525662557
18	NC_021739	ACA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662557
19	NC_021739	ACTGAA	2	12	1337	1348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525662557
20	NC_021739	GAT	2	6	1449	1454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662558
21	NC_021739	ATT	2	6	1459	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662558
22	NC_021739	TAC	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662558
23	NC_021739	TCAA	2	8	1662	1669	50 %	25 %	0 %	25 %	525662559
24	NC_021739	AC	3	6	1670	1675	50 %	0 %	0 %	50 %	525662559
25	NC_021739	AAG	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662559
26	NC_021739	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662559
27	NC_021739	TGG	2	6	1779	1784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662559
28	NC_021739	AGC	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525662559
29	NC_021739	A	6	6	1976	1981	100 %	0 %	0 %	0 %	525662559
30	NC_021739	GAT	3	9	1984	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662559
31	NC_021739	CTGA	2	8	2131	2138	25 %	25 %	25 %	25 %	525662559
32	NC_021739	GAG	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662559
33	NC_021739	TAC	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662559
34	NC_021739	CAC	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662559
35	NC_021739	TGC	2	6	2303	2308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662559
36	NC_021739	GAA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662559
37	NC_021739	AG	3	6	2512	2517	50 %	0 %	50 %	0 %	525662559
38	NC_021739	AT	3	6	2568	2573	50 %	50 %	0 %	0 %	525662559
39	NC_021739	GCTG	2	8	2598	2605	0 %	25 %	50 %	25 %	525662559
40	NC_021739	GAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662559
41	NC_021739	TAA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662559
42	NC_021739	TGA	2	6	2795	2800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662560
43	NC_021739	TTG	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662560
44	NC_021739	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662561
45	NC_021739	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	525662561
46	NC_021739	A	6	6	3064	3069	100 %	0 %	0 %	0 %	525662561
47	NC_021739	TGG	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021739	ATC	2	6	3141	3146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021739	TCAAC	2	10	3163	3172	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_021739	TCC	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021739	AG	3	6	3203	3208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021739	T	6	6	3231	3236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021739	TAAAT	2	10	3257	3266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021739	CTTT	2	8	3401	3408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021739	CAT	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021739	A	7	7	3457	3463	100 %	0 %	0 %	0 %	525662562
57	NC_021739	ACT	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662562
58	NC_021739	CAT	3	9	3715	3723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662562
59	NC_021739	CGG	2	6	3732	3737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525662562
60	NC_021739	TA	3	6	3793	3798	50 %	50 %	0 %	0 %	525662562
61	NC_021739	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
62	NC_021739	ACC	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662562
63	NC_021739	AGG	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525662562
64	NC_021739	TTC	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662562
65	NC_021739	TAAA	2	8	4202	4209	75 %	25 %	0 %	0 %	525662562
66	NC_021739	GGTT	2	8	4315	4322	0 %	50 %	50 %	0 %	525662562
67	NC_021739	AGGA	2	8	4328	4335	50 %	0 %	50 %	0 %	525662562
68	NC_021739	CTG	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662562
69	NC_021739	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662562
70	NC_021739	CTTA	2	8	4376	4383	25 %	50 %	0 %	25 %	525662562
71	NC_021739	TGA	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662562
72	NC_021739	TC	3	6	4441	4446	0 %	50 %	0 %	50 %	525662562
73	NC_021739	AGA	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
74	NC_021739	TGG	2	6	4470	4475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662562
75	NC_021739	ATT	2	6	4536	4541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662562
76	NC_021739	ATT	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662562
77	NC_021739	AGA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
78	NC_021739	ATT	2	6	4714	4719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662562
79	NC_021739	AAG	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
80	NC_021739	ATC	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662562
81	NC_021739	ATG	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662562
82	NC_021739	CCT	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525662562
83	NC_021739	TGA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662562
84	NC_021739	AAG	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662562
85	NC_021739	CAA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662562
86	NC_021739	TTG	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662562
87	NC_021739	ACC	2	6	5126	5131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525662562
88	NC_021739	TAA	2	6	5205	5210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662562
89	NC_021739	ATTC	2	8	5239	5246	25 %	50 %	0 %	25 %	525662562
90	NC_021739	A	6	6	5349	5354	100 %	0 %	0 %	0 %	525662562
91	NC_021739	T	6	6	5365	5370	0 %	100 %	0 %	0 %	525662562
92	NC_021739	AAT	2	6	5389	5394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662562
93	NC_021739	CTA	2	6	5456	5461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021739	T	9	9	5468	5476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021739	ACA	2	6	5515	5520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021739	ACC	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021739	TTG	2	6	5608	5613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662563
98	NC_021739	AAT	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662563
99	NC_021739	TA	3	6	5668	5673	50 %	50 %	0 %	0 %	525662563
100	NC_021739	TTAT	2	8	5727	5734	25 %	75 %	0 %	0 %	525662563
101	NC_021739	GAAA	2	8	5752	5759	75 %	0 %	25 %	0 %	525662563
102	NC_021739	AAT	2	6	5802	5807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662563
103	NC_021739	ATT	2	6	5856	5861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662563
104	NC_021739	TTA	2	6	6028	6033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662563
105	NC_021739	AAAC	2	8	6051	6058	75 %	0 %	0 %	25 %	525662563
106	NC_021739	ATTT	2	8	6085	6092	25 %	75 %	0 %	0 %	525662563
107	NC_021739	GAA	2	6	6106	6111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662563
108	NC_021739	AT	3	6	6145	6150	50 %	50 %	0 %	0 %	525662563
109	NC_021739	TCA	2	6	6183	6188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662563
110	NC_021739	CA	3	6	6190	6195	50 %	0 %	0 %	50 %	525662563
111	NC_021739	GAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525662563
112	NC_021739	AT	3	6	6296	6301	50 %	50 %	0 %	0 %	525662563
113	NC_021739	GA	3	6	6323	6328	50 %	0 %	50 %	0 %	525662563
114	NC_021739	A	6	6	6346	6351	100 %	0 %	0 %	0 %	525662563
115	NC_021739	ATA	2	6	6397	6402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662564
116	NC_021739	TCT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525662564
117	NC_021739	AAT	2	6	6568	6573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662564
118	NC_021739	GAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662564
119	NC_021739	GAT	2	6	6739	6744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662564
120	NC_021739	CTG	2	6	6803	6808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662564
121	NC_021739	ATT	2	6	6822	6827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662564
122	NC_021739	CTCA	2	8	6870	6877	25 %	25 %	0 %	50 %	525662564
123	NC_021739	CATT	2	8	6986	6993	25 %	50 %	0 %	25 %	525662564
124	NC_021739	T	7	7	6992	6998	0 %	100 %	0 %	0 %	525662564
125	NC_021739	ATA	2	6	7040	7045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525662564
126	NC_021739	TCA	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525662564
127	NC_021739	ACAT	2	8	7090	7097	50 %	25 %	0 %	25 %	525662564
128	NC_021739	A	6	6	7278	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021739	AGA	2	6	7337	7342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021739	AATC	2	8	7408	7415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021739	TTA	2	6	7458	7463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021739	TTA	2	6	7478	7483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021739	AGA	2	6	7492	7497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021739	CAA	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525662565
135	NC_021739	GGT	2	6	7581	7586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525662565
136	NC_021739	A	6	6	7628	7633	100 %	0 %	0 %	0 %	525662565
137	NC_021739	TGA	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525662565
138	NC_021739	TGT	2	6	7661	7666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525662565
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269	NC_021739	TGAAT	2	10	14771	14780	40 %	40 %	20 %	0 %	525662569
270	NC_021739	T	6	6	14801	14806	0 %	100 %	0 %	0 %	525662569
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392	NC_021739	ATT	2	6	20727	20732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525662574
393	NC_021739	CCG	2	6	20787	20792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525662574
394	NC_021739	A	7	7	20881	20887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_021739	TTTA	2	8	20975	20982	25 %	75 %	0 %	0 %	525662575
400	NC_021739	CTTAT	2	10	21040	21049	20 %	60 %	0 %	20 %	525662575
401	NC_021739	GCT	2	6	21053	21058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525662575
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